VetAgro Sup est un établissement public d’enseignement supérieur et de recherche sous tutelle du ministère de l’agriculture et de l’alimentation. Reconnu comme pôle d’excellence, il a pour objectif principal de former des ingénieur(e)s agronomes, des docteur(e)s vétérinaires et des inspecteur(ice)s de santé publique vétérinaire. Il contribue à la production de connaissances scientifiques pour le maintien et le développement de la santé globale de l’Homme, des animaux, des végétaux et de leur environnement.
VetAgro Sup comprend 1200 étudiant(e)s, 615 personnels (dont les enseignant(e)s/chercheur(se)s) et s’investit dans 12 unités de recherche. L’établissement est membre de l’Université de Lyon, de l’Université Clermont Auvergne et Associés, du CHEL[s] et d’Agreenium.
L’institut est implanté sur la région Auvergne-Rhône-Alpes et compte deux sites : le campus vétérinaire à Marcy-L’étoile (69) et le campus agronomique à Lempdes (63).
Le poste est basé dans l’Unité Mixte de Recherche Anses VetAgro Sup Mycoplasmoses Animales. Les missions de l’UMR MYCO sont la recherche et la formation par la recherche dans le domaine de la Mycoplasmologie chez les animaux, avec un savoir-faire historique pour les mycoplasmes des ruminants. A cela s’ajoutent des missions d’expertise et de référence propres à l’Anses ainsi que des missions d’enseignement propres à VetAgro Sup. Les travaux scientifiques de l’UMR portent sur l’étude de la biodiversité des bactéries du genre Mycoplasma et l’expression clinique des maladies associées. L’UMR pilote notamment le réseau VIGIMYC qui, outre ses missions d’épidémiosurveillance et d’aide au diagnostic auprès des laboratoires d’analyse vétérinaires, permet l’entretien d’une collection de souches sur laquelle s’appuient de nombreux projets de recherche en partenariat.
L’objectif du poste est l’appui technique aux projets de recherche de l’UMR, ainsi qu’à l’activité de surveillance de Vigimyc.
Missions
Les missions :
Participation aux projets de recherche de l’UMR, en particulier en biologie moléculaire (site Anses) :
· Sous typage des souches par des techniques de biologie moléculaire ou de génomique (extraction d’ADN, contrôles qualité associés, PCR, MLST, PFGE…),
· Caractérisation des souches par PCR (y compris contribution aux développements méthodologiques), séquençage (Sanger ou WGS) et participation aux analyses bio-informatiques,
· Réalisation de mesures de CMI (Concentrations Minimales Inhibitrices) et contribution au développement de méthodes alternatives pour la détermination de l’antibiosensibilité des souches.
Participation à l’activité de surveillance et d’aide au diagnostic du réseau Vigimyc (site Anses)
· Prise en charge des cultures envoyées par les laboratoires partenaires (enregistrement dans un logiciel dédié et mise en analyse),
· Mise en œuvre de l’identification des souches de mycoplasmes issues de ces prélèvements (membrane-filtration dot immunoblotting, PCR spécifique d’espèce, PCR 16S et séquençage, etc.)
· Gestion de la collection des souches associées.
Participation aux activités de surveillance en lien avec le projet « Mycoplasmes et troubles de la reproduction chez la chienne » (campus vétérinaire VAS).
En plus des activités de recherche sur ce projet (biologie moléculaire), sur le modèle de ce qui est fait pour Vigimyc, contribuer à la montée en puissance des activités diagnostiques pour les mycoplasmes hors ruminants, en lien avec les autres plateformes de VAS.
Activités transversales (Anses ou VAS)
· Compte-rendu individuel et participation à la traçabilité collective des essais conduits en laboratoire,
· Participation à la rédaction de protocoles, aux suivis métrologiques et à la gestion des consommables et milieux de culture (commandes et stockages secondaires),
· Participation à la formation d’étudiants stagiaires (niveau Bac à doctorat).
Profil
Compétences :
· Maitrise des techniques de biologie moléculaire et de bactériologie
· Aptitude à mettre en œuvre un protocole méthodologique précis.
· Rigueur et organisation.
· Adaptabilité et bon relationnel.
· Bonne capacité d’analyse, de réflexion et de synthèse.
· Maitrise des outils informatiques de bureautique et de logiciels pilotes de plateformes scientifiques et appétence pour la prise en main d’outils de bio-informatique.
· 100 %
Diplôme souhaité : BUT (ou équivalent) en biologie et biotechnologies
Expérience : de 2 ans minimum sur un poste similaire.
Détails du poste :
Travail sur les 2 sites de l’UMR
(Anses, Lyon 69007 et Campus vétérinaire VetAgro Sup 69280 Marcy l’étoile) en fonction des projets
Poste ouvert aux fonctionnaires, et à défaut aux contractuels (CDI)
Poste catégorie B.
Temps plein.
Rémunération à partir de 21 068 € annuelle brut, en fonction de l'expérience.
Prise de poste au 01/08/2023.
Contacts :
Envoyez votre CV et lettre de motivation au plus tard le 7 mai 2023.