Structural Bioinformatics Scientist - 2024-02/DSN-SBF
Micropep étudie à compétences égales toutes les candidatures dont celles des personnes en situation de handicap.
Micropep construit une agriculture plus durable pour les générations futures. Nous développons des solutions naturelles de protection des cultures basées sur l'incroyable potentiel des micropeptides, petites molécules protéiques naturelles qui ciblent et régulent les gènes et les protéines des plantes. Nous construisons la prochaine génération de solutions durables pour les agriculteurs qui se soucient de leurs cultures et de l'avenir de notre planète.
Micropep a été fondée en 2016 en tant que spin-off de "LRSV", un laboratoire français de recherche sur les plantes du Centre national de la recherche scientifique (CNRS) et de l'Université de Toulouse, un centre d'excellence en AgriTech. A ce jour, Micropep a levé près de 25 millions de dollars auprès d'investisseurs européens et américains de premier plan et a commencé son expansion aux Etats-Unis en 2022.
Nous sommes une équipe de plus de 40 personnes accomplies et motivées, issues de différents horizons scientifiques, techniques et commerciaux. Nous sommes unis par notre désir de laisser un impact positif sur notre planète. Ensemble, nous révolutionnons la protection des cultures grâce à notre technologie exclusive des micropeptides.
Missions
Sous la responsabilité du responsable de la plateforme de design de peptides, vous serez chargé(e) de :
- Concevoir, développer, construire et maintenir des pipelines de conception de peptides, en se concentrant sur les aspects structurels et conformationnels (mais pas uniquement).
- Maintenir une veille scientifique et technique et se tenir au courant de l'état de l'art dans les domaines de la prédiction de la structure des protéines et de la conception de peptides et de protéines, tant du point de vue de la recherche mondiale que du point de vue industriel.
- Effectuer des analyses structurelles de systèmes d'intérêt (détection de poches, analyse détaillée des interfaces protéine/protéine, de la pose d'amarrage, etc.)
- en nouant des contacts avec d'autres entreprises de conception de peptides et de protéines en vue de développer des partenariats ou de mener des projets conjoints.
Profil
- Doctorat en chimie computationnelle, en modélisation moléculaire, en biologie structurale, en apprentissage automatique ou dans un domaine connexe, avec un solide bagage théorique démontré par des contributions à des revues de premier plan ; ou une combinaison équivalente d'études et d'expérience.
- Expérience pratique de la conception, de la formation ou de l'utilisation d'outils modernes d'apprentissage profond pour la prédiction de la structure des protéines, la modélisation des protéines ou la conception des protéines (par exemple AlphaFold, ProteinMPNN, outils Rosetta, etc.).
- 3 ans ou plus d'expérience dans la prédiction et l'analyse de la structure des protéines, y compris une connaissance approfondie des progiciels et outils modernes de chimie computationnelle, avec un accent sur la dynamique moléculaire, la prédiction et l'analyse de la structure, le criblage virtuel et le docking.
- Excellentes compétences en programmation.
- Grande motivation, curiosité intellectuelle et volonté de s'épanouir dans un environnement de démarrage rapide, multidisciplinaire et axé sur le travail d'équipe.
- Bonne aptitude à la communication, tant écrite que verbale (anglais obligatoire).
- Bonne capacité d'organisation et bonne optimisation de l'environnement de travail.
- Capacité à gérer plusieurs projets et des délais qui se chevauchent.
- Capacité naturelle à résoudre des problèmes.
De préférence :
- Une expérience de travail avec des systèmes flexibles (linkers, peptides courts, IDP) est fortement appréciée.
- Une expérience de l'utilisation de PyMOL ou de Chimera est souhaitée.
- La compréhension orale du français est un atout.
CONDITIONS
Contrat temporaire de 12 mois ou de consulting
Idéalement basé à Auzeville-Tolosane (près de Toulouse, France)
Date d'entrée en fonction : avril 2024
Les candidatures (CV, lettres de motivation et références optionnelles) doivent être soumises via Flatchr avec la référence 2024-02/DSN-SBF.