Les Chambres d’Agriculture de Bourgogne Franche-Comté ont pour mission à la fois de contribuer à accompagner les agriculteurs à répondre aux enjeux d’actualité (rémunération des agriculteurs, changement climatique, renouvellement des générations…), ainsi que de contribuer à orienter les politiques régionales et départementales touchant le monde agricole.

Établissements consulaires, ayant un statut d’Établissements Publics Administratifs (EPA) pilotés par des élus professionnels, les Chambres d’Agriculture BFC bénéficient de leur autonomie administrative, en étant toutefois soumises à la tutelle des pouvoirs publics.